โดยพระคุณของพระเจ้านั้น พันธกิจบ้านสะมาเรียได้ดำเนินงานมาแล้วเป็นระยะเวลา 24 ปี (เริ่มพันธกิจ พ.ศ.2536) และโดยการทรงนำจากพระเจ้า พันธกิจบ้านสะมาเรียได้มีการเติบโต พัฒนาการ และการปรับเปลี่ยนรูปแบบการทำงานให้เหมาะสมกับเด็ก และสภาพสังคมที่เปลี่ยนแปลงอยู่ตลอดเวลา
ในช่วงแรกเป้าหมายในการดำเนินงานเน้นการเยี่ยมบ้าน ให้คำปรึกษากับผู้ปกครองเด็กฯ และช่วยเหลือเด็กเรื่องนมผง และทุนยังชีพ ต่อมาเมื่อเด็กๆ เหล่านี้เติบโตขึ้น เป้าหมายการดำเนินงานจึงเปลี่ยนจากการช่วยเหลือเรื่องนมผงเด็ก มาเป็นช่วยเหลือทุนการศึกษา, ส่งเสริมการดูแลสุขภาพให้แก่เด็กและผู้ปกครองที่ติดเชื้อฯ ที่ยังเข้าไม่ถึงยาต้านไวรัสให้ได้รับการรักษา และรวมถึงการประกาศพระกิตติคุณกับเด็กและผู้ปกครอง
“ความรักที่เราต้องการจากพี่น้อง”
การเยี่ยมเยียน การแบ่งปัน การหนุนใจ ในเรื่องคำพยานชีวิต การเรียน และอาชีพในอนาคต
ความช่วยเหลือในรูปแบบต่างๆ เช่น ข้าวสาร อาหารแห้ง อุปกรณ์กีฬา อุปกรณ์การเรียน เครื่องดนตรี
ถวายทรัพย์สนับสนุนงบประมาณ เพื่อใช้เป็นทุนการศึกษา ทุนยังชีพ
ถวายเวลาและความสามารถ เช่น การสอนดนตรี การสอนศิลปะ และทุกความสามารถด้านอื่นๆ